Transcriptoma de la respuesta a la sequía en Solanum tuberosum subsp. Andigena

Torres Ascurra, Yerisf Carla

Publicación:

Transcriptoma de la respuesta a la sequía en Solanum tuberosum subsp. Andigena

dc.contributor.author	Torres Ascurra, Yerisf Carla	es_PE
dc.date.accessioned	2024-05-30T23:13:38Z
dc.date.available	2024-05-30T23:13:38Z
dc.date.issued	2014
dc.description.abstract	El reciente desarrollo del RNA-Seq, un método de secuenciamiento masivo en paralelo para el análisis de transcriptomas permite conocer el perfil de expresión de las plantas en respuesta a estrés de tipo abiótico y biótico. En este estudio, se secuenció el mRNA proveniente de hojas y raíces de dos variedades de Solanum tuberosum subsp. andigena, una tolerante y otra susceptible, expuestas a diferentes niveles de sequía. Lecturas de 50 pares de bases provenientes de mRNA, se mapearon al genoma de papa: entre el 75 - 82% mapearon a posiciones únicas, 6 - 14% mapearon a múltiples posiciones y 9 - 12% no mapearon a posición alguna del genoma. Comparando los perfiles de expresión, se encontraron entre 887 a 1925 genes inducidos/reprimidos por sequía en la variedad susceptible y 998- 1995 en la tolerante. Se anotaron funcionalmente los 200 genes más inducidos por cada tratamiento encontrándose información primaria respecto a los procesos biológicos y moleculares involucrados durante la sequía. Finalmente, fue posible correlacionar los perfiles de expresión diferencial de los genes durante la sequía, formándose 31 módulos con aquellos genes altamente correlacionados. Este estudio generó información de gran valor que podrá ser utilizada en futuros estudios para comprender mejor los mecanismos moleculares de tolerancia a sequía en papa y especies cercanas.
dc.description.sponsorship	Universidad Cayetano Heredia. Unidad de Genómica -- Consejo de Ciencia y Tecnología (CONCYTEC)
dc.identifier.uri	https://hdl.handle.net/20.500.12390/109
dc.language.iso	spa
dc.publisher	Universidad Nacional Mayor de San Marcos
dc.rights	info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri	http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/
dc.subject	Papas (Tubérculos) - Genética
dc.subject	Papas (Tubérculos) - Cultivo	es_PE
dc.subject.ocde	https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#1.06.03
dc.title	Transcriptoma de la respuesta a la sequía en Solanum tuberosum subsp. Andigena
dc.type	info:eu-repo/semantics/masterThesis
dspace.entity.type	Publication
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