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Identificación de polimorfismos de nucleótido simple en alpaca (Vicugna pacos) usando un panel de células híbridas irradiadas alpaca/hámster
Identificación de polimorfismos de nucleótido simple en alpaca (Vicugna pacos) usando un panel de células híbridas irradiadas alpaca/hámster
| dc.contributor.author | Mamani, C.,Gutierrez, G. y Ponce de León, F. A. | es_PE |
| dc.date.accessioned | 2024-05-30T23:13:38Z | |
| dc.date.available | 2024-05-30T23:13:38Z | |
| dc.date.issued | 2017 | |
| dc.description.abstract | El objetivo del presente estudio fue identificar los polimorfismos de nucleótido simple (PNSs) usando un panel celular híbrido irradiado alpaca/hámster y una micromatriz de alta densidad del bovino. El análisis bioinformático se realizó en la Universidad Nacional Agraria La Molina. La metodología consistió en la genotipificación del panel celular y cuatro muestras controles utilizando una micromatriz de alta densidad para bovinos (BovineHD BeadChip-Illumina). El panel celular estuvo compuesto por 92 clones celulares híbridos irradiados alpaca/hámster con una retención igual o mayor al 40 % del genoma de alpaca. Los cuatro controles contuvieron ADN genómico de alpaca huacaya macho, alpaca huacaya hembra, la línea celular de hámster A23 y una mezcla de alpaca macho y hámster en una proporción de 1:10. Los análisis de datos fueron ejecutados con los programas GenomeStudio, Excel y R. Los resultados de genotipar las 4 muestras controles registraron 294,165 PNSs con señal positiva en la micromatriz y la cantidad final de PNS de alpaca después de filtrar y eliminar los PNS positivos comunes con hámster se identificaron un total de 50,686 PNS en el genoma de alpaca. En conclusión, se identificaron 6,5 % PNS del total de los PNS analizados en la micromatriz de alta densidad de bovinos. | |
| dc.description.sponsorship | Consejo Nacional de Ciencia, Tecnología e Innovación Tecnológica - Concytec | |
| dc.identifier.doi | https://dx.doi.org/10.25127/ricba.20171.242 | |
| dc.identifier.uri | https://hdl.handle.net/20.500.12390/841 | |
| dc.language.iso | spa | |
| dc.publisher | Universidad Nacional Toribio Rodríguez de Mendoza de Amazonas | |
| dc.relation.ispartof | Revista de Investigación en Ciencia y Biotecnología Animal | |
| dc.rights | info:eu-repo/semantics/openAccess | |
| dc.rights.uri | https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ | |
| dc.subject | PNS | |
| dc.subject | alpaca | es_PE |
| dc.subject | genómica | es_PE |
| dc.subject | micromatriz | es_PE |
| dc.subject.ocde | https://purl.org/pe-repo/ocde/ford#4.03.01 | |
| dc.title | Identificación de polimorfismos de nucleótido simple en alpaca (Vicugna pacos) usando un panel de células híbridas irradiadas alpaca/hámster | |
| dc.type | info:eu-repo/semantics/article | |
| dspace.entity.type | Publication |