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Caracterización de nuevos marcadores genéticos Microsatélites e identificación de SNP en el gen de Tricohialina en alpacas (Vicugna pacos)
Caracterización de nuevos marcadores genéticos Microsatélites e identificación de SNP en el gen de Tricohialina en alpacas (Vicugna pacos)
Archivos
Fecha
2014
Autores
Delgado de la Flor Montauban, Irene Rosa María
Título de la revista
Revista ISSN
Título del volumen
Editor
Universidad Peruana Cayetano Heredia
Proyectos de investigación
Unidades organizativas
Número de la revista
Abstracto
El presente trabajo tiene como objetivo la identificación y caracterización de marcadores genéticos microsatelites y polimorfismos de nucleótido simple (SNP) y evaluar su posible rol en el fenotipo Suri y Huacaya de alpacas (Vicugna pacos) de los departamentos de: Puno, Cuzco, Huancavelica, Junin, Apurimac y Arequipa. Se determinaron 6 loci microsatélites: MNA0295, MNA0218, MNA0366, MNA0388, MNA0351 y MNA0394 y para 3 SNPs: A57G, A227G y A458G de un fragmento del extremo 3`terminal (3`UTR) del gen de Tricohialina. Los marcadores microsatélites mostraron ser altamente informativos (PIC > 0.7; A > 6; Ho > 0.586, He > 0.691; PEacumulada = 0.9942). Los 3 SNP fueron identificados en un fragmento de 465bp perteneciente a la región 3´UTR del gen de Tricohialina. Los marcadores SNPs A57G y A458G son altamente informativos (PIC=0.374, Ho > 0.351, He,=0.5) y se encuentran en desequilibrio de ligamiento genotípico (p = 0). Mientras que el marcador SNP A227G es poco informativo (PIC=0.077, Ho =0.083, He,=0.081) y su alelo de menor frecuencia se encuentra presente departamentos de Huancavelica y Arequipa. Análisis de asociación entre los marcadores SNP y los fenotipos Suri y Huacaya no mostraron diferencias significativas para genotipos (p>0.5), haplotipos (p>0.5), ni en los análisis de multiples componentes. En conclusión estos resultados sugieren que los SNP identificados del gen de Tricohialina no se encuentran relacionados a los fenotipos Suri y Huacaya.
Descripción
A CONCYTEC (Consejo Nacional de Ciencia, Tecnología e Innovación Tecnológica) que financió mis estudios de Maestría.
Palabras clave
Técnicas de Genotipaje,
Repeticiones de Microsatélite,
Marcadores Genéticos,
Camélidos del Nuevo Mundo,
Genética,
Huacaya